Takeo, le samuraï sans maître, et ses compagnons d'infortune, sont poursuivis sans relâche par la plus puissante et la plus cruelle des Soeurs de l'Ombre, Furiko. Mais plutôt que de fuir, Takeo a décidé de faire face à son ennemie. Usant de ruses pour traverser un pays infesté d'ennemis, Takeo espère ainsi déjouer les machinations occultes du XIIIe prophète et d'Akuma. Mais ce dernier est en marche vers le palais impérial. À ses côtés, une armée qui grandit au fur et à mesure de sa progression menace l'Empire. Malgré leur courage et leur loyauté, les forces de l'Empereur ne sont pas de taille à lutter contre les innombrables clans ennemis qui souhaitent la chute du souverain. Takeo et son pays tout entier sont plus que jamais face à un avenir chaotique et incertain...

Les EGM (Êtres Génétiquement Modifiés) mènent un combat politique pour que leur existence soit respectée. Un des préalables conditionnant la prise en compte de leurs revendications projettera Carmen dans une mission suicide. D'abord décidée à refuser ce contrat, sa détermination est mise en échec par son talon d'Achille : l'amour qu'elle porte à Russel.